宝应地处里下河地区腹部，“金湖银荡”得天独厚，特色农业享有盛名。境内拥有耕地近100万亩，湖荡水面73万亩，是国家南水北调东线工程的源头地，是闻名遐迩的全国平原绿化先进县、中国荷藕之乡、全国园艺产品出口示范区、全国粮食生产先进县、全国唯一的有机食品基地示范县。目前，全县已形成荷藕、稻米、水产、畜禽、林木、棉纺等六大农业产业化龙头群体，有一定规模的加工（流通）企业138家，市级以上产业化龙头企业14家，其中国家级1家、省级5家，年销售总额30亿元，出口创汇7130万美元。
    水稻、水生植物、水产、水禽等“四水”是宝应农业的鲜明特色。全县常年种植水稻83万亩，总产8.5亿斤，是江苏省水稻高产县份之一。全县常年种植荷藕等水生蔬菜20多万亩，年产量30万吨，荷藕的产量、品质、出口量均居全国之冠，产品远销欧美和东南亚国家，宝应莲（荷）藕被命名为国家地理标志产品。全县三禽(鸡、鸭、鹅)饲养量2500万只，生猪出栏45万头。拥有以兴泰农牧、二妹子食品为核心的畜禽加工企业9家，年销售2亿元。宝应水产养殖面积52万亩，面积江苏第三，品质、产量分别位居江苏第一和第二，盛产鱼虾河蟹、龟鳖，年水产品总量13万吨。“宝应湖”有机大闸蟹被评为“中国十大名蟹”，高效渔业生产技术被农业部誉为“宝应模式”在全国推广。
    近年来，宝应紧紧围绕“农业增效、农民增收”，彰显地方特色，依托丰富的农业资源和优越的生态条件，大力发展有机农业，推进高效农业规模化。目前，全县已建成有机食品基地36个，面积近10万亩，形成了三大有机产业规模化基地，建成12个有机产业园区。高效农业面积已达51.3万亩，其中高效渔业25万亩。宝应湖有机农业开发区成为海峡两岸（扬州）农业合作试验区核心区。农村劳动力转移输出新增3万人。农民收入稳步提高，2007年，农民人均纯收入6129元，同比增长12.4%。